| ALK / EML4 |
| Aproximadamente 3% a 13% dos adenocarcinomas de pulmão têm o gene de fusão ALK / EML4, e caracterizam um grupo de pacientes que tem maior risco de metástases cerebrais e hepáticas, porém, pode ser responsivo à terapia alvo com inibidores da proteína ALK. Translocações associadas ao gene ALK são características do linfoma de grandes células anaplásico e em grande parte dos casos de tumor miofibroblástico inflamatório / pseudotumor inflamatório. |
| BCl-2 |
| O gene BCL-2 (B-cell CLL/lymphoma 2, a.k.a. PPP1R50) codifica uma proteína da membrana mitocondrial que regula a apoptose e é expresso em células B. Translocações envolvendo o gene BCL-2 são comumente identificados em linfomas de célula B. A translocação t (14; 18) (q32.3; q21.3) foi identificado em cerca de 80% dos linfomas, em 20% a 30% do linfoma difuso de grandes células B, e raramente na leucemia linfocítica crônica de células B. A superexpressão do gene BCL2 confere resistência à quimioterapia. Daí a detecção de translocações BCL-2 por fluorescência de hibridização in situ (FISH). |
| BCL-6 |
| Rearranjos da região cromossômica do gene BCL-6 ocorrem em diferentes tipos de linfoma não-Hodgkin, incluindo células B difuso e linfoma folicular. A translocação BCL-6 t (3; 14) (q27; q32.3) resulta na fusão do gene IGH-BCL6. As translocações BCL6 representam uma das mais frequentes anormalidade citogenética, ocorrendo em 20% a 40% dos casos. |
| BCR/ABL1 |
| BCR/ ABL1 é indicado para a detecção das translocações específicas que envolvam a região cromossômica 9q34.12 albergando o gene ABL1 (ABL), e região cromossômica 22q11.23, albergando o gene (BCR1) (BCR). Rearranjos envolvendo t (9; 22) (Q34.1; q11.2) são observados em aproximadamente 90% dos pacientes com leucemia mielóide crônica (LMC) e em aproximadamente 25% de adultos com leucemia linfoblástica aguda. Os rearranjos são citogeneticamente caracterizados pela presença do cromossomo Philadelphia (Ph). A translocação resulta frequentemente na formação de um BCR quimérico / fusão ABL1gene no cromossoma 22. O produto gênico é uma proteína BCR / ABL1 com atividade anormal de tirosina-quinase. Dentro de células normais, a atividade da quinase é finamente regulada, em resposta a fatores de crescimento e outros estímulos. A fusão BCR / ABL1 conduz à ativação constitutiva de vias de sinalização, incluindo RAS, JAK / STAT e PI-3 quinase. |
| C-MYC |
| Translocações envolvendo o gene C-MYC estão associadas ao diagnóstico do linfoma de Burkitt e estão presentes em alguns casos de linfoma de células da zona do manto. A amplificação do gene C-MYC é observada em carcinomas uroteliais, estando relacionada a alto grau histológico e crescimento invasivo. |
| COL1A1/ PDGFB |
| COL1A1 é indicado para a detecção das translocações específicas que envolvam a região cromossômica 17q21.33 albergando o gene COL1A1 (a.k.a. OI4). Translocações recíprocas envolvendo t(17; 22)(q21.3; q13.1) são característicos do dermatofibrossarcoma protuberans (DFSP). DFSP Sarcoma de Pele é altamente recorrente, infiltrativo e de malignidade intermediária. Os rearranjos são citogeneticamente caracterizados pela presença de cromossomas supranumerários em anel contendo sequências amplificadas de baixo nível de cromossomos 17q21-qter e 22q10-q13.1, ou derivados desequilibrados do t (17; 22)(Q21.3; q13.1) translocação. O rearranjo freqüentemente resulta em formação de uma proteína de fusão COL1A1-PDGFB, e resulta em ativação autócrina / ou parácrina do receptor de fator de crescimento-β (PDGFRB). O diagnóstico preciso do DFSP é importante por causa da natureza intermediária maligna do DFSP e pode ser facilitada pela análise por hibridação in situ fluorescente (FISH). |
| EGR1/5P15 |
| EGR1 / 5p15 é indicado para a detecção de deleções de genes EGR1. O gene EGR1 (resposta de crescimento precoce 1) está localizado na região cromossômica 5q31.2. As deleções que abrangem a região 5q31.2 estão entre as mais comuns anormalidades detectáveis em síndromes mielodisplásicas (MDS) e leucemia mielóide aguda (AML). A proteína EGR1 é uma proteína nuclear e funciona como um regulador transcricional de Supressão EGR1 em carcinomas de mama RE negativo e está correlacionada com um grau de tumor mais elevado, sugerindo que a perda do gene EGR1 (e assim perda do funcionamento da proteína EGR1) podem contribuir para a patogênese do carcinoma de mama negativo para receptor de estrogênio. |
| ESR1/CEN6 |
| ESR1/CEN6 é indicado para a detecção de amplificação do gene ESR1 frequentemente observado no câncer da mama. O gene ESR1 (receptor de estrogênio 1) está localizado na região cromossômica 6q25.1 e codifica receptor alfa de estrogênio (RE). Expressão de RE é um dos mais importantes fatores conhecidos no desenvolvimento de câncer de mama. |
| ETV6/RUNX1 |
| ETV6/RUNX1 é indicado para a detecção da translocação específica envolvendo a região cromossômica 12p13.2 abriga o ETV6 (variante ETS do gene 6) e a região cromossômica 21q22.12 albergando o gene RUNX1 (fator de transcrição relacionados com o 1, a.k.a. AML1). A translocação cromossômica equilibrada t (12; 21) (p13.2; q22.1), leva a ETV6 fusão / RUNX1, e representa o mais frequente rearranjo genético na leucemia aguda linfoblástica (LLA) (19-27%) e tem sido associada com bom prognóstico. |
| EWSR1 |
| São observadas translocações envolvendo o gene EWSR1 entre diversos sarcomas de células redondas – 100% dos tumores de pequenas células redondas desmoplásicos e mais de 95% dos sarcomas de Ewing / PNET – tumor neuroectodérmico primitivo, além de sarcoma de células claras, fibro-histiocitoma angiomatóide, condrossarcoma mixóide extraesquelético e alguns lipossarcomas de células redondas também têm rearranjos de EWSR1. Translocações envolvendo o gene EWSR1 estão presentes em mais de 80% dos casos de carcinoma de células claras hialinizante de glândula salivar e em nenhum de seus principais diagnósticos diferenciais. Outra aplicação do exame de FISH EWSR1 é a diferenciação entre melanoma maligno e sarcoma de células claras e deve ser sempre realizado em indivíduos com tumores melanocíticos em partes moles, uma vez que o sarcoma de células claras é um sarcoma de partes moles raro, com semelhanças morfológicas e imuno-histoquímicas com o melanoma maligno, o que faz com que frequentemente seja diagnosticado como melanoma. |
| FUS |
| FUS é indicado para detectar translocações que envolvem a região cromossômica 16p11.2 região que alberga o gene FUS (também conhecido como TLS, FUS / TLS,hnRNP P2). Portanto, a detecção de rearranjos FUS através de hibridização in situ é uma ferramenta valiosa para confirmar o diagnóstico histopatológico de lipossarcoma mixóide. |
| HER2 |
| A pesquisa de amplificação do gene HER2 (ou c-erbB-2) auxilia na seleção de pacientes com adenocarcinoma de mama ou de estômago que podem ser beneficiados com tratamento imunoterápico baseado na injeção de anticorpos anti HER2. A imunoterapia é um tipo de terapia-alvo, já que este anticorpo de uso medicamentoso ataca e mata somente as células tumorais que exibem grandes quantidades deste receptor como consequência da amplificação do gene HER2. A principal indicação do exame de FISH HER2 são os casos “duvidosos” no exame de imuno-histoquímica (resultado 2+). Nestes casos encontra-se marcação fraca na imuno-histoquímica, portanto a amplificação gênica deve ser corfirmada ou não pelo exame de FISH; caso o resultado da relação gene HER2 / cromossmo 17 seja superior a 2.2 o caso é considerado positivo para amplificação do gene HER2 e, portanto, indicativo de imunoterapia. Pacientes com neoplasias sem amplificação do gene HER2 não se beneficiam do tratamento imunoterápico, já que não possuem o alvo terapêutico. Outra abordagem existente é a pesquisa inicial do estado de gene HER2 por FISH, dispensando a imuno-histoquímica; pesquisadores que advogam a favor desta abordagem justificam que há casos (cerca de 10%) com de exame imuno-histoquímico negativo para HER2 e com exame de FISH positivo ou vice-versa e que estes pacientes não receberiam ou não seriam beneficiados pela imunoterapia se fossem submetidos à abordagem convencional de exames em 2 etapas (imuno-histoquímica inicial, seguida de FISH somente nos casos duvidosos). |
| IGH |
| Translocações envolvendo o gene IGH (14q32.33) são evento crítico na patogênese do mieloma múltiplo, da gamopatia monoclonal de significado indeterminado (MGUS) e da maioria dos linfomas não Hodgkin, podendo auxiliar particularmente no diagnóstico diferencial destas entidades com estados reacionais / inflamatórios. |
| IRF4 |
| O IRF4 é normalmente expresso em plasmócitos, melanócitos, algumas células B,e em células T ativadas. Rearranjos da região cromossômica IRF4 / DUSP22 foram detectados em vários linfomas de células B e de células T. Linfoma de grandes células B com o rearranjo de IRF4, ocorre mais comumente em crianças e jovens. A translocação do IRF4 tem um alta especificidade para linfoma de células anaplásicas cutâneas, apoiando a utilidade clínica do FISH para IRF4 no diagnóstico diferencial de distúrbios linfoproliferativos de células T. Além disso, o rearranjo de DUSP22 em ALK-negativo está associado com um resultado favorável indicando a utilidade do DUSP22 como um biomarcador preditivo. |
| MDM2 |
| A amplificação do gene MDM2 é observada em 85% dos casos de lipossarcoma bem diferenciado / tumor lipomatoso atípico e 100% dos lipossarcomas desdiferenciados e condrossarcomas. É de grande utilidade no diagnóstico diferencial com lesões lipomatosas benignas, como lipoma de células fusiformes e lipoblastoma. A amplificação do gene MDM2 também é observada em osteossarcomas. |
| MYB |
| O gene MYB é expresso em células hematopoiéticas e na maioria das leucemias e tumores sólidos. Translocações afetando MYB são detectadas em Leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T) e carcinoma adenoide cístico (ACC). Estudos recentes identificaram um subgrupo de LLA-T com translocação t (6; 7) (q23.3; q34) que justapõe MYB e TCRB (célula T receptor beta) levando à ativação da expressão de MYB. |
| MYC |
| MYC Dual é indicado para detectar translocações que envolvem a região cromossômica 6q23.3. O gene MYc é expresso predominantemente em células progenitoras hematopoiéticas imaturas e é altamente expressa na maioria das leucemias e em alguns tumores sólidos. As translocações que afetam MYB tem sido detectados em leucemia linfoblástica aguda de células T (T-ALL) e carcinoma adenóide cístico (ACC). |
| N-MYC |
| A amplificação do gene N-myc é um importante fator prognóstico e preditivo no neuroblastoma, identificando os pacientes com doença rapidamente progressiva que respondem mal à terapia convencional. Também pode ser utilizado na detecção de doença residual mínima após tratamento. A amplificação dos genes c-myc ou N-myc é identificada com pouca freqüência no meduloblastoma, tumor maligno embrionário do cerebelo porém, quando presente, é associada com pior prognóstico. |
| PML/RARA |
| PML / RARA é indicado para detectar a translocação t (15; 17) (q24; q21.2) afetando o gene PML na região cromossômica 15q24.1 e o locus RARA em 17q21.2. As translocações que envolvem a PML (leucemia promielocítica , MYL) e o gene RARA (receptor alfa do ácido retinóico,) são considerados característico para a leucemia promielocítica aguda (LPA), um subtipo de Leucemia mielóide. |
| RMS I E II |
| Duas sondas úteis para o diagnóstico preciso de rabdomiossarcoma alveolar, distinguindo-o de outros tumores de pequenas células redondas, como sarcoma de Ewing / PNET e do rabdomiossarcoma embrionária. Estão relacionadas com as translocações / genes de fusão t(2;13)/PAX7-FOXO1(FKHR) e t(1;13)/PAX7-FOXO1(FKHR), respectivamente. |
| SOX2/CEN3 |
| SOX2/CEN 3 é designado para a detecção de amplificações de genes SOX2 frequentemente observados em carcinoma de células escamosas (SCC), do pulmão, do esôfago, da cavidade bucal, e outros órgãos. Além de amplificações e / ou a sobre-expressão foram encontrados em gliomas, câncer da mama, e outros tipos de tumores. |
| SS18 |
| SS18 é indicado para detectar translocações que envolvem o cromossomo 18q11.2 região SS18 (sarcoma de translocação sinovial, cromossomo18) gene (a.k.a. SYT). As translocações que envolvem a região18q11.2 são encontrados em mais de 90% dos casos de sarcoma sinovial. Entre sarcomas de tecidos moles, o sarcoma sinovial é um dos mais comuns e ocorre nas extremidades de adultos jovens com maior prevalência em homens, embora, a ocorrência de sarcoma sinovial também tem sido descrito em uma ampla variedade de localizações anatômicas e em todas as idades. |
| TFE3 |
| TFE3 é indicado para detectar translocações que envolvem a região cromossômica Xp11.23 albergando o gene TFE3 (Fator de transcrição de ligação a IGM potenciador 3, TFEA). As translocações que envolvem a região cromossômica Xp11.2 são frequentemente detectadas em carcinomas de células renais (RCC), que geralmente afetam crianças e adolescentes. |
| TP53/CEN17 |
| TP53/CEN17 é indicado para a detecção de deleções TP53 de genes observados por exemplo em casos de leucemia linfocítica crônica (LLC)/ Linfoma Linfocítico. O gene TP53 (ou também proteína do tumor 53, p53, BCC7, LFS1, TRP53) localiza-se na região cromossômica 17p13.1 e codifica um fator de transcrição 53 kDa que regula a proliferação celular, diferenciação, apoptose e que funciona como um supressor de tumor, ativando a expressão de genes que inibem a célula de crescimento. |
| VHL/CEN3 |
| VHL/CEN 3 é indicado para a detecção de deleções que afetam o gene de VHL. O gene supressor tumoral VHL (von Hippel-Lindau) está localizado em 3p25.3 e codifica uma proteína de 30 kDa. A proteína está envolvida na ubiquitinação e degradação do hypoxia-inducible factor-(HIF), que é um fator de transcrição que desempenha um importante papel na regulação da expressão do gene pelo oxigênio. Estudos sugerem que a determinação do status da VHL por FISH pode significativamente melhorar a precisão da avaliação da biópsia de tumor renal. |
| 1P36/1Q25 + 19Q13/19P13 |
| A co-deleção dos braços cromossômicos 1 p e 19q é característica de tumores oligodendrogliais e está associada a melhor prognóstico e maior resposta à terapia. Estas deleções genéticas ocorrem também em cerca de 20% dos neurocitomas extraventriculares e podem estar associadas com histologia agressiva destes tumores. |
| 13/CEN18/SPEC21 TRIPLE |
| 13/CEN18/SPEC21 TRIPLE é indicado para ser usado para a detecção dos cromossomos humanos 13,18,21 com sequencias específicas 13q12, 18 alfa satélite e 21q22. |